More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3331 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3331  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 399 aa  822    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  42.59 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2607  alkanesulfonate monooxygenase  42.35 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3988  alkanesulfonate monooxygenase  42.59 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  0.0666689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3531  alkanesulfonate monooxygenase  42.59 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1534  alkanesulfonate monooxygenase  39.49 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185363  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7799  Alkanesulfonate monooxygenase  38.11 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  40.72 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  40.87 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.44 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  42.33 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  41.42 
 
 		 367 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  40.62 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  40.54 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  40 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.58 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  41.39 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  35.19 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 		 388 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  34.39 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  34.59 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  36.36 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  37.69 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  34.92 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  34.34 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.39 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  34.81 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  34.92 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  36.65 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  34.18 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  34.47 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  34.55 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  36.5 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  33.77 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  33.77 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  33.77 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  33.77 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  34.16 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  34.57 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  34.55 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  34.57 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.16 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  34.66 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  36.73 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  34.57 
 
 		 381 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  33.92 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  34.49 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  33.51 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  33.16 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  32.9 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  32.91 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.74 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.13 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  33.51 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  32.99 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  36.11 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  34.29 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  33.17 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  34.72 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  34.72 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  37.09 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  32.97 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  34.2 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  33.78 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  33.94 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  33.94 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  33.6 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.71 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  33.77 
 
 		 380 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  33.51 
 
 		 399 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  34.11 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1579  Alkanesulfonate monooxygenase  36.24 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  36.97 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  34.3 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  32.01 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 		 382 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.39 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.21 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  34.22 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  34.22 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  35.09 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>