More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1579 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1579  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
390 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  70.88 
 
 
394 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  61.26 
 
 
364 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  59.11 
 
 
387 aa  424  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  56.27 
 
 
389 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  56.27 
 
 
389 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  56.27 
 
 
389 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  56.92 
 
 
417 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  58.6 
 
 
395 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  58.47 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  60.05 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  57.5 
 
 
380 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  55.91 
 
 
393 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  54.55 
 
 
374 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  51.62 
 
 
367 aa  359  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  54.97 
 
 
360 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  53.19 
 
 
364 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  50.63 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  52.59 
 
 
377 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  50 
 
 
381 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  51.65 
 
 
385 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  48.48 
 
 
381 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  52.2 
 
 
385 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  52.2 
 
 
385 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  51.1 
 
 
379 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  51.37 
 
 
385 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  51.62 
 
 
389 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  51.52 
 
 
380 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  51.37 
 
 
371 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  51.51 
 
 
379 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  51.79 
 
 
380 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  48.37 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
387 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  51.62 
 
 
399 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  51.1 
 
 
371 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  51.1 
 
 
371 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  47.87 
 
 
382 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  50.81 
 
 
387 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  48.48 
 
 
381 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  49.73 
 
 
387 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  49.37 
 
 
476 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
382 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  50.41 
 
 
382 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
385 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
385 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
382 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
382 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  51.65 
 
 
385 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
382 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  47.3 
 
 
375 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  50.7 
 
 
402 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 
382 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  47.84 
 
 
381 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  47.84 
 
 
381 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  49.62 
 
 
386 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  46.58 
 
 
381 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  49.31 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  47.8 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  48.6 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  47.34 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  46.33 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  47.34 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  46.79 
 
 
381 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  49.18 
 
 
382 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
395 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  47.09 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  47.54 
 
 
404 aa  309  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
382 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
382 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  46.08 
 
 
391 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  48.46 
 
 
391 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  47.54 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  46.43 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  48.63 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  48.92 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  52.76 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
503 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  50.28 
 
 
387 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  50.68 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  49.18 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  50.7 
 
 
405 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1239  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1836  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 
385 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
394 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  46.15 
 
 
381 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  46.96 
 
 
380 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>