More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1372 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
394 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1579  Alkanesulfonate monooxygenase  70.88 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  60.7 
 
 
395 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  59.41 
 
 
417 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  57.29 
 
 
389 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  57.29 
 
 
389 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  57.29 
 
 
389 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  59.09 
 
 
378 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  56.52 
 
 
387 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  57.77 
 
 
364 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  57.54 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  57.92 
 
 
393 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  58.54 
 
 
380 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  51.64 
 
 
374 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  50.41 
 
 
367 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  51.23 
 
 
377 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  51.64 
 
 
364 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  50.54 
 
 
386 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  49.74 
 
 
391 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  52.73 
 
 
399 aa  338  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  53.02 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  50.13 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  52.88 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  51.66 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  49.49 
 
 
391 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  48.67 
 
 
381 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
385 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  51.38 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  49.2 
 
 
379 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  50.94 
 
 
395 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  48.62 
 
 
381 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  49.59 
 
 
387 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
389 aa  332  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  48.32 
 
 
385 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  48.06 
 
 
385 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
371 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  49.04 
 
 
396 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  50 
 
 
381 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  51.67 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  49.09 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  49.47 
 
 
381 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  50.4 
 
 
395 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  49.2 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  50.28 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  49.09 
 
 
382 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  48.83 
 
 
382 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  48.91 
 
 
391 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  48.84 
 
 
385 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 
381 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  51.89 
 
 
387 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  48.83 
 
 
382 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
392 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
382 aa  322  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  49.46 
 
 
385 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  49.19 
 
 
385 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  49.19 
 
 
385 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  47 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
382 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
386 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  46.01 
 
 
380 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
391 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  49.34 
 
 
382 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
503 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 
382 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1836  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1239  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  47.5 
 
 
381 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 
387 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  48.72 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  49.05 
 
 
391 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  48.62 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  49.04 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  47.79 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  50.28 
 
 
382 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  47.24 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  47.24 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  47.51 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  48.34 
 
 
404 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  47.24 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  47.24 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  47.24 
 
 
381 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  47.96 
 
 
387 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  49.05 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  47.41 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  47.51 
 
 
381 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  46.13 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  48.26 
 
 
384 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  47.96 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  48.28 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  48.28 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>