More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1371 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  80.88 
 
 		 387 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  88.11 
 
 		 387 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  82.17 
 
 		 387 aa  658    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 387 aa  779    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  81.91 
 
 		 387 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  79.59 
 
 		 387 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  78.01 
 
 		 391 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  77 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  75.06 
 
 		 389 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  70.03 
 
 		 386 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  70.03 
 
 		 385 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  68.99 
 
 		 385 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  68.73 
 
 		 385 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  70.8 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  68.99 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  70.8 
 
 		 386 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  68.99 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  68.99 
 
 		 385 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  68.99 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  68.99 
 
 		 385 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1836  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1239  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401522  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  69.51 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  66.06 
 
 		 381 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  69.25 
 
 		 385 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  68.31 
 
 		 381 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  66.92 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  66.75 
 
 		 382 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  66.67 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  68.39 
 
 		 381 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  65.37 
 
 		 402 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  66.67 
 
 		 382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  66.58 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  65.45 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  64.52 
 
 		 379 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  65.39 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  65.45 
 
 		 382 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  65.04 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  64.52 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  67.27 
 
 		 382 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  64.92 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  64.4 
 
 		 381 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  65.18 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  64.66 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  64.66 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  64.55 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  63.32 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  64.4 
 
 		 381 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  67.32 
 
 		 381 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  62.79 
 
 		 391 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  64.4 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  65.55 
 
 		 379 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  63.87 
 
 		 380 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  62.96 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  65.97 
 
 		 382 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  65.97 
 
 		 382 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  63.35 
 
 		 391 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  61.44 
 
 		 375 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  63.61 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  60.47 
 
 		 381 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  63.09 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  60.7 
 
 		 371 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  65.04 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  64.84 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  61.62 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  61.76 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 		 370 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  61.87 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  62.6 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  62.83 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  61.62 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  63.48 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  61.38 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  60.47 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  61.7 
 
 		 382 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  57.66 
 
 		 380 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5472  sulfonate monooxygenase  59.27 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  55.88 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  58.43 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  58.15 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  54.14 
 
 		 388 aa  359  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3814  luciferase-like protein  48.6 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  51.31 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  51.63 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>