More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3342 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 348 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  98.56 
 
 		 351 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  82.75 
 
 		 350 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  75.87 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  75.22 
 
 		 344 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  68.1 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  68.6 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  68.51 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  68.79 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  61.88 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  58.5 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  63.95 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  47.14 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3499  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.65 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3572  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase  42.65 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3512  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.14 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792396  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  33.14 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  32.3 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  32.57 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  29.69 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  30.85 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  30.77 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  30.77 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  33.24 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  31.52 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  31.83 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  32 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  29.86 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  30.37 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  34.23 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.43 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  31.44 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  33.9 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  33.05 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  30.68 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.86 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  33.05 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  31.73 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  29.97 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  30.86 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  31.73 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  30.86 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  30.86 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  32.83 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  28.69 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  32.01 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  30.29 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  32.19 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  31.36 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  30.75 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  32.68 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  32.19 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  30.23 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  32.58 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  31.16 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.74 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  34.31 
 
 		 476 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.82 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.6 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  31.88 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.01 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  34.15 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  30.88 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  30.45 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  33.06 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  30.45 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  29.36 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.02 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  28.61 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.02 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.92 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.92 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  30.9 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  31.66 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  30.79 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  31.78 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  30.08 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  29.25 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  30.58 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  30.98 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  29.53 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  31.78 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  30.18 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>