More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3499 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3499  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
324 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3572  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
324 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3512  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  90.74 
 
 
297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792396  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  55.64 
 
 
364 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  51.94 
 
 
353 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  52.16 
 
 
366 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  52.36 
 
 
389 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  51.16 
 
 
353 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  43.23 
 
 
351 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  43.23 
 
 
348 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  43.39 
 
 
344 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  51.34 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  41.35 
 
 
346 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  48.09 
 
 
352 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  43.97 
 
 
362 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  50.39 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  29.23 
 
 
378 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  29.21 
 
 
367 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  29.32 
 
 
369 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  28.84 
 
 
367 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  28.84 
 
 
367 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  28.84 
 
 
367 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  28.96 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  28.73 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  28.97 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  27.72 
 
 
383 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  28.09 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  25.94 
 
 
363 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  29.46 
 
 
370 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  27.86 
 
 
364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  27.86 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  29.62 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  25.94 
 
 
363 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  27.48 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  27.1 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.18 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  33.7 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  32.82 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30.04 
 
 
371 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  26.69 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31.25 
 
 
380 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  28.46 
 
 
370 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  27.8 
 
 
389 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  27.8 
 
 
376 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  28.46 
 
 
370 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.95 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  30.5 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.6 
 
 
381 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  27.07 
 
 
364 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  32.85 
 
 
375 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  26.34 
 
 
425 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  33.08 
 
 
378 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  27.07 
 
 
364 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  32.3 
 
 
379 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  24.91 
 
 
369 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  30.5 
 
 
392 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  32.09 
 
 
380 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  32.6 
 
 
382 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  31.25 
 
 
382 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.95 
 
 
381 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  33.58 
 
 
381 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  29.96 
 
 
381 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  33.58 
 
 
381 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  30.8 
 
 
382 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  33.58 
 
 
381 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  30.8 
 
 
382 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  32.62 
 
 
387 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  30.37 
 
 
382 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  26.74 
 
 
369 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  25.19 
 
 
364 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32 
 
 
381 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  25.57 
 
 
364 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  26.15 
 
 
386 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  33.21 
 
 
381 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  33.21 
 
 
381 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  28.52 
 
 
385 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  33.21 
 
 
381 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  33.21 
 
 
381 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  33.21 
 
 
381 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.17 
 
 
381 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  28.68 
 
 
364 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  32.25 
 
 
387 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  31.54 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 
382 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  31.6 
 
 
396 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  27.38 
 
 
381 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  31.87 
 
 
393 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  25.57 
 
 
393 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  31.77 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  26.49 
 
 
385 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  31.37 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  31.77 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  31.77 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  31.58 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>