More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2538 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  100 
 
 
352 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  64.62 
 
 
350 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  60.68 
 
 
366 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  61.63 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  62.64 
 
 
364 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  61.05 
 
 
353 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  61.11 
 
 
344 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  59.29 
 
 
389 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  61.79 
 
 
346 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  58.79 
 
 
351 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  58.5 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  60.47 
 
 
361 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  49.43 
 
 
362 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3499  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.09 
 
 
324 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3572  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase  48.09 
 
 
324 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3512  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.84 
 
 
297 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792396  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  31.93 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  33.23 
 
 
378 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  34.51 
 
 
369 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  31.43 
 
 
352 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
370 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  32.49 
 
 
381 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  31.73 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  30.06 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  33.56 
 
 
366 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  30.06 
 
 
363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  31.07 
 
 
364 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 
370 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
366 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  32.92 
 
 
364 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  31.01 
 
 
364 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  31.91 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  31.91 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  31.91 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  31.91 
 
 
367 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 
367 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  30.23 
 
 
364 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
367 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  30.11 
 
 
403 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  32.02 
 
 
366 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  31.96 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  32.92 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  30.03 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  31.87 
 
 
385 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.23 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.77 
 
 
371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  31.76 
 
 
370 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  30.06 
 
 
389 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  29.91 
 
 
383 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  31.66 
 
 
382 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  30.06 
 
 
376 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  32.74 
 
 
391 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  31.39 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  29.4 
 
 
369 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  31.9 
 
 
387 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  29.86 
 
 
385 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  33.74 
 
 
404 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  30.14 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  32.52 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  28.7 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.53 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.53 
 
 
364 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  31.12 
 
 
385 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  31.13 
 
 
379 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  31.76 
 
 
379 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  31.9 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  30.46 
 
 
387 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  32.23 
 
 
377 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  29.83 
 
 
380 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  30.77 
 
 
393 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  29.88 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  29.41 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.08 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  30.82 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.52 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.21 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  31.55 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  30.77 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  30.67 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  31.87 
 
 
476 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  31.66 
 
 
374 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  32.09 
 
 
395 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  31.25 
 
 
391 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  30.95 
 
 
385 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  30.95 
 
 
385 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  31.52 
 
 
387 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  30.95 
 
 
385 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  31.48 
 
 
384 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  29.5 
 
 
386 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  31.97 
 
 
381 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1636  Alkanesulfonate monooxygenase  31.67 
 
 
376 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  30.51 
 
 
392 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>