More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1497 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
385 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  71.02 
 
 
389 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  71.02 
 
 
376 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  70.14 
 
 
383 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  68.98 
 
 
385 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  69.03 
 
 
370 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  68.18 
 
 
369 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  64.38 
 
 
403 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  62.43 
 
 
364 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  62.43 
 
 
364 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  61.41 
 
 
364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  60.43 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  62.91 
 
 
364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  61.3 
 
 
364 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  61.02 
 
 
366 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  62.91 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  62.91 
 
 
364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  59.73 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  60.39 
 
 
363 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  60.11 
 
 
363 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  59.89 
 
 
367 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  62.64 
 
 
364 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  60.16 
 
 
364 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  60.17 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  58.52 
 
 
367 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  58.06 
 
 
366 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  57.69 
 
 
366 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  59.5 
 
 
367 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  60.68 
 
 
370 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  59.5 
 
 
367 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  59.5 
 
 
367 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  57.38 
 
 
369 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  59.89 
 
 
367 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  59.89 
 
 
367 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  59.83 
 
 
381 aa  414  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  57.87 
 
 
370 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  58.15 
 
 
370 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  58.92 
 
 
371 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  52.2 
 
 
393 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  50.98 
 
 
382 aa  358  9e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  31.18 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  32.49 
 
 
352 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  32.2 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.83 
 
 
380 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  34.86 
 
 
350 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  34.64 
 
 
367 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  30.59 
 
 
366 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 
351 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 
348 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.3 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  37.2 
 
 
360 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
364 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  33.79 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  32.23 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  30.28 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  31.3 
 
 
367 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
392 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  33.16 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  33.05 
 
 
389 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  33.33 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  33.33 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  32.01 
 
 
344 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
346 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.93 
 
 
351 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  30.97 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  30.22 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 
389 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  31.87 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  30.06 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  31.63 
 
 
353 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  31.75 
 
 
391 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  30.14 
 
 
384 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7799  Alkanesulfonate monooxygenase  31.33 
 
 
383 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  30.87 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  28.5 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  32.43 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  30.97 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  29.62 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  28.22 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  28.5 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  28.93 
 
 
380 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  29.26 
 
 
391 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  28.25 
 
 
381 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  30.21 
 
 
387 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 
368 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  28.21 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  31.45 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  31.45 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  26.89 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  28.27 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  31.05 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  28.96 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  29.83 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  28.98 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>