More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3300 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
366 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  72.3 
 
 
353 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  71.43 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  69.1 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  68.39 
 
 
351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  69.05 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  68.1 
 
 
348 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  67.06 
 
 
344 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  70.06 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  62.06 
 
 
389 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  64.74 
 
 
364 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  60.68 
 
 
352 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  52.01 
 
 
362 aa  358  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3499  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.28 
 
 
324 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3572  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase  49.28 
 
 
324 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3512  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.87 
 
 
297 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792396  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  33.14 
 
 
352 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  32.57 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  34.71 
 
 
382 aa  176  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  30.05 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  29.2 
 
 
364 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  29.66 
 
 
381 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  30.31 
 
 
378 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  28.01 
 
 
369 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  30.59 
 
 
385 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  31.04 
 
 
367 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  31.04 
 
 
367 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  31.04 
 
 
367 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  31.74 
 
 
367 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  30.75 
 
 
367 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
367 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  31.74 
 
 
367 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  29.01 
 
 
364 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
370 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  27.79 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  28.81 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  28.92 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  29.39 
 
 
366 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 
383 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  29.8 
 
 
370 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  29.09 
 
 
366 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  30.85 
 
 
364 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.71 
 
 
351 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  29.91 
 
 
371 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  30.81 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  30.81 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  27.68 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  27.68 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  28.83 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  26.5 
 
 
363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  31.71 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
370 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  26.5 
 
 
363 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
370 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  29.13 
 
 
364 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  31.83 
 
 
375 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  32.29 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  28.37 
 
 
369 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  31.42 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  32.2 
 
 
393 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  30.56 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  30.79 
 
 
405 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 
374 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  32.1 
 
 
392 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  30.67 
 
 
380 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  27 
 
 
385 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  29.13 
 
 
393 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  30.36 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  32.24 
 
 
395 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  31.04 
 
 
391 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  30.27 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  31.72 
 
 
384 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  30.19 
 
 
379 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  29.82 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  30.91 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  29.38 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  30.15 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.48 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  29.38 
 
 
391 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  29.69 
 
 
380 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  31.76 
 
 
381 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  30.5 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  30.09 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  30.4 
 
 
370 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  30.38 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  31.4 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  29.25 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  29.09 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  30.4 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2679  luciferase-like protein  32.41 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.147238  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  30.4 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  31.45 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  29.5 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  28.92 
 
 
386 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>