More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 380 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  43.84 
 
 		 386 aa  318  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  44.26 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  39.83 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  43.44 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  38.48 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  37.95 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  35.83 
 
 		 371 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  35.46 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  36.49 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  36.09 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  35.45 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  33.24 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  33.24 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  33.24 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  33.71 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  33.24 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  30.48 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  32.78 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  32.69 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  35.99 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.38 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  33.8 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  32.01 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  31.82 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  31.67 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  35.63 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  30.97 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  31.25 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.25 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  31.13 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  32.4 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  30.59 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  32.15 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.23 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  31.87 
 
 		 395 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.23 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  32.56 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  32.22 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  31.16 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  30.41 
 
 		 395 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  30.41 
 
 		 395 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  30.84 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  32.19 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  31.62 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  31.64 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.4 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  28.46 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  32.2 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  31.92 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  31.92 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  31.92 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  31.92 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  31.92 
 
 		 363 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  31.92 
 
 		 363 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  31.96 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  30.64 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  30.83 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  28.69 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  31.64 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.29 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  30.23 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  30.03 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.19 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  29.58 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  31.74 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  29.33 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  29.01 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  28.13 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  29.33 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  30.19 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  30.26 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  30.51 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1941  alkanesulfonate monooxygenase  26.32 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  26.48 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3362  alkanesulfonate monooxygenase  25.81 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3814  luciferase-like protein  27.38 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.453442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>