More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4216 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  100 
 
 		 363 aa  750    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.91 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  37.46 
 
 		 358 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.78 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  37.22 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  35.88 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  34.58 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  34.75 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  35.04 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  35.31 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  33.33 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  33.89 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  33.33 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  33.33 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  33.33 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  33.33 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  33.33 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  33.51 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  33.71 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  33.15 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  34.92 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  33.06 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  32.39 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  32.96 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  33.43 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  34.08 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  33.16 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.64 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  30.39 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 		 384 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  30.93 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  30.08 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  30.06 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  30.03 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  30.61 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  31.29 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  31.9 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.38 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.38 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  31.48 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  29.51 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  28.4 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  29.74 
 
 		 452 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  25 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  25 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  27.58 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  28.68 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  24.86 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  28.3 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  29.23 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  30.6 
 
 		 469 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  28.4 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  25.14 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  27.47 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  30.51 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  29.15 
 
 		 452 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2817  putative luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 433 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  27.62 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  26.05 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  27.99 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  25.56 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  30.3 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  26.12 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  30.43 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  29.75 
 
 		 478 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  24.65 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  25.91 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  31.12 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  27.13 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  24.4 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  25.21 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  27.44 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  29.48 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  24.36 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  24.36 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  24.36 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.63 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  27.96 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  26.27 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  27.8 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  30.94 
 
 		 469 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  30.4 
 
 		 463 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>