More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5029 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
463 aa  959    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  63.7 
 
 
470 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  63.7 
 
 
470 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  63.7 
 
 
470 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  61.56 
 
 
457 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  62.17 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  62.22 
 
 
456 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  63.41 
 
 
465 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  62.93 
 
 
472 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  59.78 
 
 
452 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  62.75 
 
 
470 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  63.64 
 
 
472 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  62.08 
 
 
464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  62.08 
 
 
464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  62.08 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  58.89 
 
 
452 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  61.86 
 
 
472 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  61.86 
 
 
464 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  59.24 
 
 
454 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  61.86 
 
 
472 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  58.85 
 
 
464 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  59.78 
 
 
462 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  62.08 
 
 
464 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  59.78 
 
 
462 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  58.67 
 
 
452 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  58.63 
 
 
461 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  58.41 
 
 
461 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  58.85 
 
 
463 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  58 
 
 
452 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  58.22 
 
 
463 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  57.43 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  55.23 
 
 
454 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  56.17 
 
 
467 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  56.3 
 
 
463 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  54.88 
 
 
461 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.29 
 
 
454 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  55.09 
 
 
469 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  55.09 
 
 
469 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  57.24 
 
 
469 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  56.79 
 
 
478 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  56.07 
 
 
467 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  53.49 
 
 
467 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  54.32 
 
 
454 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  54.2 
 
 
469 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  54.2 
 
 
469 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  53.28 
 
 
466 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  53.15 
 
 
465 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  53.2 
 
 
465 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  53.06 
 
 
466 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  53.45 
 
 
480 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  53.3 
 
 
470 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  53.23 
 
 
480 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  53.23 
 
 
480 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.67 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  51.79 
 
 
463 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  50.33 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  50.66 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.66 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  50.65 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  52.76 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  51.64 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  50.87 
 
 
467 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  49.22 
 
 
468 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  50.11 
 
 
468 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  53.78 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.11 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  53.33 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  50.91 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.11 
 
 
462 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  50.78 
 
 
466 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  50.55 
 
 
469 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  49.57 
 
 
483 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  47.85 
 
 
467 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  51.88 
 
 
466 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  51.88 
 
 
466 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  51.66 
 
 
466 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  49.32 
 
 
462 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  48.45 
 
 
459 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  45.63 
 
 
482 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  44.69 
 
 
481 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  43.2 
 
 
486 aa  378  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  42.07 
 
 
461 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.3 
 
 
458 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  42.86 
 
 
460 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.64 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  42.64 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  43.67 
 
 
458 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  43.05 
 
 
460 aa  353  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  42.02 
 
 
505 aa  353  5e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  42.2 
 
 
493 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  41.33 
 
 
452 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  42.77 
 
 
460 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  41.43 
 
 
457 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
461 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3516  putative monooxygenase  39.82 
 
 
470 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.418377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>