More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2397 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  95.15 
 
 		 454 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  100 
 
 		 463 aa  944    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  95.25 
 
 		 463 aa  882    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  60.94 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  60.94 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  59.23 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  60.49 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  60.94 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  60.94 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  60.94 
 
 		 467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  60.71 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  57.67 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  57.67 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  56.37 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  57.14 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  57.14 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  56.06 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  58.58 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  56.7 
 
 		 469 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  56.25 
 
 		 465 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  56.47 
 
 		 467 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  56.03 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  54.14 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  55.15 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  55.41 
 
 		 480 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  55.48 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  55.26 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  54.97 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  54.97 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  54.39 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  52.92 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  51.97 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  52.7 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  54.39 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  54.61 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  54.81 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  54.61 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.59 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  52.92 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  54.5 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.91 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  55.93 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  54.02 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  53.59 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  55.7 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  54.57 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  53.9 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  53.9 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  53.9 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.79 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  53.14 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  54.67 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  55.56 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  50.89 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  53.9 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  53.67 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  54.12 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  54.14 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  52.13 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  52.68 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  52.13 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  53.38 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  52.13 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  51.68 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  51.9 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  54.22 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  51.9 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  51.78 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  51.26 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  52.46 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  49.44 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  51.45 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  52.35 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  53.02 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.11 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  48.43 
 
 		 454 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  50.78 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  48.88 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.35 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  47.58 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  54.35 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.9 
 
 		 469 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.76 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  48.47 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  47.53 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  46.14 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  44.89 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  46.49 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  43.17 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  43.21 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  45.82 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.33 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  43.33 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  44.08 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  42.31 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  41.89 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  42.42 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3576  putative monooxygenase  42.98 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0535027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>