More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2543 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  68.51 
 
 
469 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  68.4 
 
 
461 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  67.63 
 
 
466 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  67.19 
 
 
466 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  80.58 
 
 
467 aa  776    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  83.26 
 
 
467 aa  791    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  80.09 
 
 
466 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  79.82 
 
 
466 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  83.37 
 
 
469 aa  786    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  83.7 
 
 
467 aa  798    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  75.44 
 
 
468 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  83.7 
 
 
467 aa  798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  100 
 
 
462 aa  950    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  79.82 
 
 
466 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  68.29 
 
 
469 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  67.25 
 
 
469 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  66.89 
 
 
467 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  80.04 
 
 
466 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  67.25 
 
 
469 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  65.03 
 
 
465 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  65.01 
 
 
465 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  63.04 
 
 
467 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  63.04 
 
 
467 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  62.81 
 
 
467 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  63.04 
 
 
467 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  63.04 
 
 
467 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  62.59 
 
 
467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  60.77 
 
 
467 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  59.5 
 
 
461 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  57.01 
 
 
480 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  56.79 
 
 
480 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  56.79 
 
 
480 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  53.39 
 
 
454 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  56.11 
 
 
483 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  53.39 
 
 
460 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.2 
 
 
463 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.56 
 
 
473 aa  481  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  50.55 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  51.26 
 
 
463 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  51.03 
 
 
454 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  50.23 
 
 
454 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.8 
 
 
463 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  50.34 
 
 
454 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.28 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.14 
 
 
460 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  49.12 
 
 
461 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  49.89 
 
 
456 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  50.23 
 
 
463 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.12 
 
 
461 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  47.96 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  48.97 
 
 
457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.43 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
470 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  47.96 
 
 
452 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  49.09 
 
 
464 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  49.22 
 
 
462 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
470 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
470 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  51.32 
 
 
470 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  49.22 
 
 
462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  50.9 
 
 
452 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  48.78 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  50.45 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  50.9 
 
 
465 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  49.43 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
470 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  50 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  50 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  50 
 
 
464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  50.23 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  49.44 
 
 
457 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  50 
 
 
464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  49.43 
 
 
468 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  50 
 
 
464 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  50.34 
 
 
468 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  49.77 
 
 
472 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  49.32 
 
 
463 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  49.43 
 
 
457 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  47.48 
 
 
459 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  48.07 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  47.1 
 
 
486 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  47.38 
 
 
478 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.8 
 
 
462 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  48.99 
 
 
408 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  45.35 
 
 
454 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  44.05 
 
 
507 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  43.47 
 
 
481 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  43.17 
 
 
505 aa  363  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  43.41 
 
 
460 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0250  hypothetical protein  42.55 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.99 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  42.7 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  39.82 
 
 
457 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  42.28 
 
 
458 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.68 
 
 
460 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  39.68 
 
 
460 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  39.46 
 
 
460 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  40.05 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>