More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5217 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  84.92 
 
 
472 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  84.62 
 
 
464 aa  791    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  98.24 
 
 
470 aa  925    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  84.92 
 
 
464 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
472 aa  971    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  97.03 
 
 
470 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  84.07 
 
 
464 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  79.03 
 
 
468 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  95.26 
 
 
465 aa  875    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  98.02 
 
 
470 aa  923    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  84.62 
 
 
472 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  98.94 
 
 
472 aa  958    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  98.02 
 
 
470 aa  923    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  84.92 
 
 
472 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  84.62 
 
 
464 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  64.68 
 
 
452 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  64.46 
 
 
452 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  65.58 
 
 
457 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  63.71 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  61.93 
 
 
454 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  64.63 
 
 
463 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  63.07 
 
 
461 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  64.27 
 
 
462 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  64.27 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  63.94 
 
 
464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  62.23 
 
 
456 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  62.31 
 
 
467 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  63.15 
 
 
463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  60.26 
 
 
463 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  60.62 
 
 
454 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  60.84 
 
 
452 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  62.2 
 
 
478 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  59.34 
 
 
463 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  58.41 
 
 
452 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  59.65 
 
 
454 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 
454 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 
469 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  56.77 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  56.77 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  56.77 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  56.77 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  56.77 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  56.55 
 
 
467 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  55.65 
 
 
469 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  55.82 
 
 
465 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  55.65 
 
 
469 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  55.82 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  54.95 
 
 
467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  56.76 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  53.41 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  55 
 
 
461 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  54.55 
 
 
469 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  52.75 
 
 
466 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  53.88 
 
 
469 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  57.64 
 
 
457 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  53.9 
 
 
454 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  54.12 
 
 
463 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.67 
 
 
463 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  56.33 
 
 
457 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  52.81 
 
 
468 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  51.6 
 
 
460 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  54.53 
 
 
470 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  53.61 
 
 
480 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.55 
 
 
473 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  53.39 
 
 
480 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  53.39 
 
 
480 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  49.34 
 
 
461 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  49.14 
 
 
468 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  49.22 
 
 
467 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.76 
 
 
460 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  51.09 
 
 
483 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  52.11 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  50.78 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  52.11 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  52.11 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.78 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  49.67 
 
 
467 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  49.67 
 
 
467 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  49.45 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  49.67 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.89 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  50.11 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  51.35 
 
 
459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  48.15 
 
 
482 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  46.87 
 
 
481 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  43.54 
 
 
486 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  46.5 
 
 
460 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  45.91 
 
 
458 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  39.54 
 
 
505 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  47.04 
 
 
408 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  41.25 
 
 
461 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  40.79 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  42.64 
 
 
460 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  43.16 
 
 
457 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.42 
 
 
460 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  42.42 
 
 
460 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  43.82 
 
 
460 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3554  hypothetical protein  43.06 
 
 
475 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  40.53 
 
 
452 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  41.59 
 
 
461 aa  339  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>