More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3662 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  944    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  61.25 
 
 
493 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  59.87 
 
 
458 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  55.82 
 
 
468 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3504  putative monooxygenase  54.95 
 
 
470 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3516  putative monooxygenase  54.95 
 
 
470 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.418377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3576  putative monooxygenase  54.95 
 
 
470 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  51.91 
 
 
452 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  49.56 
 
 
461 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  44.77 
 
 
480 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  44.22 
 
 
452 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  44.37 
 
 
452 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  44.77 
 
 
480 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1269  putative monooxygenase  46.12 
 
 
461 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0330886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  44.77 
 
 
480 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  43.88 
 
 
467 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  44.64 
 
 
452 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  44.54 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  44.54 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  44 
 
 
452 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  44.54 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  44.54 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  44.54 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  44.32 
 
 
467 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  44.27 
 
 
462 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  42.92 
 
 
454 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  44.42 
 
 
456 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  43.27 
 
 
461 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  44.27 
 
 
462 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  44.02 
 
 
457 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  43.08 
 
 
464 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  44.14 
 
 
463 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  42.98 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  42.32 
 
 
461 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  43.26 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.2 
 
 
467 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
463 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  42.63 
 
 
468 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  43.91 
 
 
468 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  41.07 
 
 
469 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  40.98 
 
 
460 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.65 
 
 
461 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  41.52 
 
 
469 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  41.29 
 
 
461 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  41.83 
 
 
483 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  41.29 
 
 
467 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  42.6 
 
 
469 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  40.58 
 
 
467 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  41.52 
 
 
469 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  41.52 
 
 
469 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  41.2 
 
 
466 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  40.98 
 
 
466 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  42.66 
 
 
463 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 
470 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
470 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
470 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.52 
 
 
473 aa  342  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  40.39 
 
 
463 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  40.84 
 
 
454 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  41.74 
 
 
469 aa  339  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  40.18 
 
 
465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.17 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  41.08 
 
 
454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  41.94 
 
 
454 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  39.51 
 
 
465 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  42.21 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  42.21 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  42.21 
 
 
472 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  41.99 
 
 
472 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  41.99 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  42.44 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  41.96 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  41.99 
 
 
472 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  41.98 
 
 
465 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  41.52 
 
 
467 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  41.96 
 
 
466 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
472 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  41.59 
 
 
472 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  41.52 
 
 
467 aa  333  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  43.15 
 
 
469 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  41.03 
 
 
454 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  41.96 
 
 
466 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  41.43 
 
 
459 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  41.29 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  41.04 
 
 
462 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  41.07 
 
 
467 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  40.96 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  40.57 
 
 
482 aa  326  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  41.61 
 
 
464 aa  326  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  42.25 
 
 
478 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.43 
 
 
462 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  39.42 
 
 
457 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  38.75 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  37.45 
 
 
505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  41.59 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  43.77 
 
 
408 aa  312  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  40.75 
 
 
458 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  40.87 
 
 
457 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  37.06 
 
 
468 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  39.58 
 
 
460 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>