More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3872 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  70.11 
 
 
469 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  69.21 
 
 
466 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  67.83 
 
 
467 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  69.37 
 
 
466 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  83.26 
 
 
462 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  78.57 
 
 
466 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  78.49 
 
 
466 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  69.08 
 
 
469 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  98.29 
 
 
467 aa  950    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  100 
 
 
467 aa  965    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  69.01 
 
 
461 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  75.97 
 
 
467 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  65.87 
 
 
465 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  78.57 
 
 
466 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  68.32 
 
 
469 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  68.32 
 
 
469 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  72.94 
 
 
468 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  78.79 
 
 
466 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  97.86 
 
 
467 aa  946    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  92.54 
 
 
469 aa  881    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  64.58 
 
 
465 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  65.27 
 
 
467 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  65.27 
 
 
467 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  65.27 
 
 
467 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  65.27 
 
 
467 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  65.27 
 
 
467 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  65.04 
 
 
467 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  62.39 
 
 
467 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  61.81 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  59.78 
 
 
480 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  59.33 
 
 
480 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  59.33 
 
 
480 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  59.42 
 
 
483 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  54.53 
 
 
454 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.43 
 
 
463 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.06 
 
 
473 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  54.1 
 
 
460 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.81 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  52.48 
 
 
463 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  53.81 
 
 
454 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  51.75 
 
 
463 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  52.89 
 
 
470 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  52.43 
 
 
460 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.91 
 
 
469 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  49.67 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  50.76 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.44 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  50.67 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  50.44 
 
 
454 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  50.76 
 
 
462 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  50.22 
 
 
457 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  49.45 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  51.64 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  50.22 
 
 
456 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  50.11 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  51.11 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.11 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  50.79 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  50.79 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  50.79 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  50.33 
 
 
463 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  50.11 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  51.11 
 
 
468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  50.88 
 
 
457 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  49.67 
 
 
465 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  49.11 
 
 
452 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  50.78 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  49.57 
 
 
472 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  50.22 
 
 
472 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  50.22 
 
 
464 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  49.78 
 
 
464 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  49.67 
 
 
470 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  49.78 
 
 
472 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  48.44 
 
 
452 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  50.22 
 
 
464 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  50.22 
 
 
457 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  49.67 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49.89 
 
 
469 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  46.7 
 
 
482 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  49.22 
 
 
459 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.02 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  45.3 
 
 
486 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  46 
 
 
454 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  49.87 
 
 
408 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  44.96 
 
 
507 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  44.85 
 
 
505 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  43.05 
 
 
481 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  44.54 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  44.3 
 
 
458 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.26 
 
 
452 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
458 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  39.82 
 
 
457 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0250  hypothetical protein  40.92 
 
 
442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  39.87 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  38.77 
 
 
461 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  40.31 
 
 
493 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  39.02 
 
 
460 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>