More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2746 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  967    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  68.94 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  85.02 
 
 		 469 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  81.96 
 
 		 466 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  67.7 
 
 		 467 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  67.7 
 
 		 467 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  83.19 
 
 		 467 aa  802    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  82.17 
 
 		 466 aa  799    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  69.82 
 
 		 467 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  67.26 
 
 		 467 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  67.47 
 
 		 466 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  66.37 
 
 		 467 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  70.11 
 
 		 467 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  92.84 
 
 		 461 aa  896    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  67.6 
 
 		 468 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  68.51 
 
 		 462 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  67.7 
 
 		 467 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  71.98 
 
 		 465 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  70.04 
 
 		 467 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  83.16 
 
 		 469 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  72.91 
 
 		 465 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  67.48 
 
 		 467 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  97.23 
 
 		 469 aa  944    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  67.7 
 
 		 467 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  66.81 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  67.02 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  67.02 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  64.54 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  63.47 
 
 		 480 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  62.03 
 
 		 461 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  63.25 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  63.25 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  60.04 
 
 		 454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  59.6 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  59.65 
 
 		 483 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.89 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  56.24 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  55.97 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  56.7 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  56.47 
 
 		 454 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  52.98 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  52.98 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  54.08 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  56.07 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.07 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  54.22 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  53.86 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.64 
 
 		 461 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  55.88 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  53.33 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  55.88 
 
 		 472 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  55.65 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  55.65 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  55.88 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.88 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  55.09 
 
 		 463 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  55.65 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  55.65 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  54.77 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  53.42 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  54.32 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  52.98 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  54.99 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  54.32 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  53.12 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  53.08 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  53.63 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  55.73 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  53.22 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  54.75 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  52.55 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  51.33 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  53.98 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  53.79 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  54.1 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  53.63 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  50 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.22 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.2 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  53.66 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  47.62 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  48.89 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  47.14 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  47.3 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  46.35 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  47.59 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  44.57 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  42.33 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  44.57 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.88 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  41.78 
 
 		 493 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  40.13 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  41.52 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  40.71 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.71 
 
 		 460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  40.71 
 
 		 460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>