More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1560 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  100 
 
 
461 aa  948    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  68.49 
 
 
480 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  68.49 
 
 
480 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  68.27 
 
 
480 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  69.06 
 
 
483 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  64.69 
 
 
467 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  64.69 
 
 
467 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  64.69 
 
 
467 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  64.69 
 
 
467 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  64.47 
 
 
467 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  64.25 
 
 
467 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  63.18 
 
 
467 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  63.36 
 
 
461 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.78 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  63.58 
 
 
467 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  62.69 
 
 
469 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  62.03 
 
 
466 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  62.03 
 
 
469 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  62.03 
 
 
469 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  62.03 
 
 
469 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  61.81 
 
 
466 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  60.93 
 
 
467 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  61.59 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  59.82 
 
 
465 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  60.26 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  61.81 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  61.81 
 
 
467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  61.59 
 
 
466 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  61.59 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  60.71 
 
 
469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  59.16 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  60.71 
 
 
466 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  61.37 
 
 
466 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  59.5 
 
 
462 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  57.81 
 
 
460 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.73 
 
 
463 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.07 
 
 
454 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  54.14 
 
 
463 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.02 
 
 
463 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  52.8 
 
 
454 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.99 
 
 
467 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  50.44 
 
 
456 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  49.67 
 
 
452 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  51.11 
 
 
462 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  49.23 
 
 
452 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  50.88 
 
 
462 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  49.56 
 
 
457 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  49.34 
 
 
454 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  49.56 
 
 
461 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  49.78 
 
 
464 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  49.78 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  50.33 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.01 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  48.12 
 
 
463 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  47.81 
 
 
454 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  50.99 
 
 
464 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.54 
 
 
460 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
470 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
470 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.45 
 
 
469 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  50.11 
 
 
452 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  52.65 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  49.56 
 
 
472 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  49.67 
 
 
482 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  49.56 
 
 
472 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  49.67 
 
 
464 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  49.34 
 
 
472 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  49.67 
 
 
464 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  49.45 
 
 
470 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  49.56 
 
 
472 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  49.67 
 
 
464 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  49.78 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  50 
 
 
468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  49.23 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  49.56 
 
 
470 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  49.12 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  48.75 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  47.82 
 
 
486 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 
469 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49.78 
 
 
478 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  48.03 
 
 
457 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.37 
 
 
462 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  46.46 
 
 
454 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  45.01 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  45.47 
 
 
481 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  51.27 
 
 
408 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  45.4 
 
 
507 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  44.76 
 
 
458 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  43.13 
 
 
460 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  41.98 
 
 
452 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  41.74 
 
 
468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3516  putative monooxygenase  41.34 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.418377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3504  putative monooxygenase  41.34 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3576  putative monooxygenase  41.34 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.27 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  40.74 
 
 
461 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2812  hypothetical protein  42.89 
 
 
458 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>