More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6112 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
384 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  59.64 
 
 
397 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  62.02 
 
 
392 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  48.07 
 
 
386 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  42.7 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  43.36 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  42.18 
 
 
376 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.83 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  40.05 
 
 
385 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  35.1 
 
 
367 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  35.29 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  32.07 
 
 
355 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  35.22 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
406 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  29.92 
 
 
387 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 
353 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.73 
 
 
364 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.17 
 
 
395 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.17 
 
 
395 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  32.65 
 
 
389 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  30.75 
 
 
395 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
389 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  30.49 
 
 
364 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  30.49 
 
 
354 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  29.83 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
395 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  31.23 
 
 
363 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  29.51 
 
 
360 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.65 
 
 
366 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  25.95 
 
 
376 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  25.95 
 
 
389 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  27.55 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  28.8 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  26.23 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  25.88 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  25.27 
 
 
369 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  29.13 
 
 
393 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  29.13 
 
 
363 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  29.13 
 
 
363 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  29.13 
 
 
393 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  29.13 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  29.13 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  26.06 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  25.27 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  29.25 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  25.73 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  26.33 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  24.39 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  25.82 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  24.35 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  28.1 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  26.26 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  27.47 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  24.6 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  25.82 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  24.59 
 
 
383 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  24.67 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  28.3 
 
 
360 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  33.97 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  25.07 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  25.33 
 
 
366 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  25.07 
 
 
363 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  25.07 
 
 
366 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  25.27 
 
 
364 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  24.34 
 
 
364 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  26.43 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  24.6 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  25.33 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  25.33 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  25 
 
 
364 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  24.73 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  25.33 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  27.67 
 
 
356 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  24.73 
 
 
364 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 
370 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  27.41 
 
 
461 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  25.68 
 
 
371 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  26.74 
 
 
372 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  26.18 
 
 
376 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  25.72 
 
 
385 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  26.12 
 
 
376 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  23.72 
 
 
369 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  24.28 
 
 
403 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  31.11 
 
 
381 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  28.72 
 
 
363 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  25.88 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  27.54 
 
 
352 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  23.08 
 
 
482 aa  93.6  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  26.28 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  27.08 
 
 
352 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  26.3 
 
 
364 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>