More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2588 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 389 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  72.75 
 
 		 389 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  68.44 
 
 		 389 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  66.32 
 
 		 389 aa  546  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  54.31 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  54.57 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  54.57 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  52.82 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  56.4 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  53.52 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  45.27 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  31.32 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  31.22 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  30.26 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  31.82 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.17 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  29.48 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  30.64 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  30.64 
 
 		 378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  29.91 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  31.27 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  30.14 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  30.66 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  30.79 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  30.99 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  30.03 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  29.86 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  29.86 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  29.86 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  28.41 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  30.08 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  29.51 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  29.51 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  29.31 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  29.31 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  29.44 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  27.67 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  27.67 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  28.02 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  29.78 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  30.5 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  28.74 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  27.7 
 
 		 370 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  29.85 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  28.18 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.65 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  29.46 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  30.16 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.44 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.02 
 
 		 364 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  28.74 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  27.89 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 367 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  30.66 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  29.67 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  29.55 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  29.48 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  27.81 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  25.77 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  28.86 
 
 		 364 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  30.81 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  28.74 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  27.95 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  27.14 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  28.78 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  26.92 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  26.92 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  26.92 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  26.92 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  27.06 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  26.92 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  26.92 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  27.81 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  28.12 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  26.63 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  26.63 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  28.36 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  27.76 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  26.88 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  27.03 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  26.76 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  27.56 
 
 		 354 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  26.3 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  26.47 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  28.16 
 
 		 448 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  27.09 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3622  Alkanesulfonate monooxygenase  24.66 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>