More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4260 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  79.26 
 
 		 378 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  100 
 
 		 380 aa  784    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  46.63 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  45.23 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  42.7 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  40.79 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  39.53 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  41.44 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.49 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  37.87 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  36.71 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  32.07 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  30.59 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  30.59 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  31.46 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  29.76 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  28.41 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30.72 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  28.31 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.42 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  29.24 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  30.16 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  29.75 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.42 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.42 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  29.77 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  29.77 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  29.45 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  29.45 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  31.17 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  31.48 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  29.19 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  30.61 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  29.19 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  29.19 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  29.75 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  31.27 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.27 
 
 		 395 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.27 
 
 		 395 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  29.14 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  26.93 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  28.45 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  29.66 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  27.99 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  28.61 
 
 		 364 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  28.24 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  28.83 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  28.78 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  28 
 
 		 366 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.67 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  27.91 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  26.3 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  29.71 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.54 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  27.51 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  27.21 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  31.58 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  28.49 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  32.09 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  32.71 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  32.71 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  32.71 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  32.71 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  32.71 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  32.71 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  32.71 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  32.71 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  30.94 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  26.6 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  28.62 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  31.18 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  29.4 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2679  luciferase-like protein  30.69 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.147238  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  33.16 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  30.04 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  26.39 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  27.69 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  25.84 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  27.03 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  27.81 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  25.14 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  29.7 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  29.04 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  27.8 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  27.88 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  27.44 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  25.66 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>