More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1792 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  100 
 
 
354 aa  731    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  58.64 
 
 
355 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.49 
 
 
364 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  51.45 
 
 
364 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  50.14 
 
 
358 aa  342  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  46.11 
 
 
353 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.31 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  37.5 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  38.4 
 
 
383 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  36.08 
 
 
370 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  38.79 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 
376 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  38.62 
 
 
360 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  36.06 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  38.79 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  38.51 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  38.07 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  38.07 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  38.07 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  36.69 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  38.07 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  38.07 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
376 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  37.15 
 
 
381 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  34.75 
 
 
363 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  36.36 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  36.99 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  35.69 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.45 
 
 
380 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  35.24 
 
 
354 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  33.15 
 
 
367 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  33.15 
 
 
367 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  33.98 
 
 
371 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  31.55 
 
 
378 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  32.1 
 
 
386 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.59 
 
 
364 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.59 
 
 
364 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  30.41 
 
 
364 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  31.56 
 
 
397 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 
425 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  31.65 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
364 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  31.27 
 
 
366 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  30.81 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  29.69 
 
 
367 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  31.01 
 
 
369 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  29.28 
 
 
376 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  29.28 
 
 
389 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  30.25 
 
 
366 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  29.69 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  29.69 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  29.69 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  29.78 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 
367 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  31.22 
 
 
366 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.78 
 
 
366 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  32.4 
 
 
370 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  32.59 
 
 
370 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 
370 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  30.79 
 
 
364 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 
384 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  30.39 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
367 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  33.94 
 
 
385 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  30.68 
 
 
376 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 
371 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  29.43 
 
 
369 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  28.81 
 
 
383 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  29.1 
 
 
363 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  31.65 
 
 
392 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  29.11 
 
 
385 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  30.47 
 
 
382 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  29.1 
 
 
363 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  30.61 
 
 
378 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.1 
 
 
362 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  30.28 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  31.46 
 
 
380 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  29.69 
 
 
364 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  33.61 
 
 
406 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  28.65 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  34.71 
 
 
395 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  34.71 
 
 
395 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  34.71 
 
 
395 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
395 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
350 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  27.45 
 
 
403 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 
392 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  28.37 
 
 
393 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  32.41 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  30.89 
 
 
380 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  27.58 
 
 
352 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 
389 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  27.4 
 
 
352 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  28.95 
 
 
381 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30.25 
 
 
380 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  25 
 
 
381 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  31.64 
 
 
445 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>