More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5432 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  100 
 
 
371 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  54.6 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  36.71 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.83 
 
 
380 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  36.71 
 
 
380 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  37.09 
 
 
378 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  36.97 
 
 
385 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  34.99 
 
 
376 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  34.17 
 
 
397 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  33.61 
 
 
392 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  32.88 
 
 
387 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  31.43 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  33.98 
 
 
354 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  34.92 
 
 
366 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  34.09 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  34.09 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  33.05 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  33.24 
 
 
367 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  34.01 
 
 
364 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  33.24 
 
 
367 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  33.24 
 
 
367 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.88 
 
 
395 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
367 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  32.96 
 
 
367 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  32.69 
 
 
366 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  32.61 
 
 
395 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  32.61 
 
 
395 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  32.36 
 
 
406 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  32.56 
 
 
364 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  33.24 
 
 
378 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.14 
 
 
364 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  32.17 
 
 
364 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  31.75 
 
 
369 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  31.65 
 
 
358 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  32.28 
 
 
364 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
395 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  32.09 
 
 
353 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
389 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
370 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  31.3 
 
 
364 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
370 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  30.97 
 
 
364 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  30.97 
 
 
364 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 
425 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  31.07 
 
 
364 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  31.03 
 
 
369 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  30.84 
 
 
364 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  31.12 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  31.12 
 
 
363 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
371 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  30.46 
 
 
376 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 
389 aa  146  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  30.46 
 
 
389 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  29.6 
 
 
370 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  30.46 
 
 
383 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  31.71 
 
 
389 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 
366 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
353 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  31.02 
 
 
369 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  30.93 
 
 
363 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  30.06 
 
 
385 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  29.69 
 
 
385 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.73 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  26.84 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  27.82 
 
 
367 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  28.34 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  27.81 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  28.25 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  26.48 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  28.42 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.59 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  26.91 
 
 
360 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  29.2 
 
 
393 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  26.63 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  27.79 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  25.99 
 
 
366 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  28.16 
 
 
352 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  25.99 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  26.55 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  26.55 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.126668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  26.55 
 
 
382 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  26.55 
 
 
382 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  26.55 
 
 
393 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  26.55 
 
 
393 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  27.44 
 
 
352 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  26.55 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  28.57 
 
 
448 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  26.74 
 
 
451 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
463 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.86 
 
 
467 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  29.62 
 
 
445 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>