More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3663 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  87.29 
 
 		 371 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  99.73 
 
 		 370 aa  753    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  92.7 
 
 		 370 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 370 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  78.21 
 
 		 366 aa  591  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  78.89 
 
 		 366 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  80.11 
 
 		 363 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  80.11 
 
 		 364 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  79.89 
 
 		 363 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  78.65 
 
 		 366 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  78.24 
 
 		 364 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  77.69 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  78.24 
 
 		 369 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  77.47 
 
 		 364 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  76.37 
 
 		 366 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  77.13 
 
 		 364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  71.86 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  71.86 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  71.86 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  73.18 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  71.04 
 
 		 367 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  71.58 
 
 		 367 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  71.58 
 
 		 367 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  70.6 
 
 		 367 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  70.44 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  71.94 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  71.94 
 
 		 364 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  71.67 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  72.19 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  59.89 
 
 		 369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  59.73 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  58.63 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  58.63 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  58.99 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  57.64 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  56.68 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  55.16 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  56.21 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54.02 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  51.99 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  34.64 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  34.92 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  32.61 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  30.46 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.92 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  32.87 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  31.28 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.02 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.02 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.41 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  36.13 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  36.13 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  32.95 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  32.51 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  30.11 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  34.5 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  33.99 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 395 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  34.57 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  31.59 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  34.57 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  33.9 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.44 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  31.93 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  30.28 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  27.72 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  33.06 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  28.8 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  34.03 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  33.43 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  28.01 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  32.76 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  34.22 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  29.33 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  31.17 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  32.28 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  32.71 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  34.55 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  32.48 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  31.4 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  31.9 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  31.7 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  33.61 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  32.62 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  30.42 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>