More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3477 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
389 aa  782    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  62.06 
 
 
366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  62.28 
 
 
353 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  62.43 
 
 
364 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  62.28 
 
 
353 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  62.35 
 
 
346 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  59.29 
 
 
352 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  60.68 
 
 
350 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  60.7 
 
 
344 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  61.21 
 
 
351 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  61.88 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  60.82 
 
 
361 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  50.14 
 
 
362 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3499  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.36 
 
 
324 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3572  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase  52.36 
 
 
324 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3512  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  51.53 
 
 
297 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792396  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  34.78 
 
 
352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  34.78 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.56 
 
 
351 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  32.48 
 
 
370 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  31.92 
 
 
369 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 
370 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.39 
 
 
371 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  31.86 
 
 
363 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  32.31 
 
 
364 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  32.82 
 
 
370 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  31.17 
 
 
366 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  31.56 
 
 
363 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 
382 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  31.71 
 
 
364 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  31.18 
 
 
364 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
383 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  35.24 
 
 
380 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  31 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 
389 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 
376 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  31.49 
 
 
378 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  30 
 
 
369 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  30.7 
 
 
366 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  35.42 
 
 
393 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  31.4 
 
 
364 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  32.04 
 
 
403 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 
366 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.15 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  32.21 
 
 
367 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  31.6 
 
 
367 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  31.6 
 
 
367 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  31.6 
 
 
367 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  29.54 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  30.92 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  31.32 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  30 
 
 
364 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
367 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  31.6 
 
 
367 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 
367 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  31.09 
 
 
381 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  33.05 
 
 
385 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  30.1 
 
 
385 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 
364 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 
386 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  31.99 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  31.99 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  31.89 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  31.89 
 
 
364 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  31.7 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  31.16 
 
 
385 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.08 
 
 
381 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.02 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  32.75 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  31.52 
 
 
379 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  32.74 
 
 
476 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  31.9 
 
 
402 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.28 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  30.17 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3331  alkanesulfonate monooxygenase  31.9 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  32.42 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  30.47 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  32.15 
 
 
392 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  32 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  30.53 
 
 
375 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.08 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  31.27 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  32.29 
 
 
395 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  30.7 
 
 
404 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  31.21 
 
 
385 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  31.21 
 
 
385 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2607  alkanesulfonate monooxygenase  33.86 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  30.55 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3988  alkanesulfonate monooxygenase  32.11 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  0.0666689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  33.13 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  30.09 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3531  alkanesulfonate monooxygenase  32.11 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>