More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3993 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
381 aa  770    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  61.45 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  62.32 
 
 
389 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  61.39 
 
 
376 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  57.78 
 
 
403 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  61.93 
 
 
383 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  59.78 
 
 
369 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  59.62 
 
 
385 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  59.66 
 
 
364 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  58.93 
 
 
385 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  59.38 
 
 
364 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  56.86 
 
 
364 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  57.51 
 
 
363 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  57.79 
 
 
366 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  57.43 
 
 
366 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  57.22 
 
 
364 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  57.51 
 
 
363 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  58.92 
 
 
364 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  57.14 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  58.64 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  56.82 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  58.64 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  55.68 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  58.64 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  55.96 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  56.21 
 
 
369 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  57.43 
 
 
366 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  56.15 
 
 
369 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  55.4 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  56.13 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  55.4 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  55.4 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  55.4 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  55.34 
 
 
378 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  54.7 
 
 
367 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  55.87 
 
 
370 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  55.87 
 
 
370 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  56.03 
 
 
371 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  50.57 
 
 
393 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  47.77 
 
 
382 aa  318  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  31.68 
 
 
362 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  31.69 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  29.66 
 
 
366 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  31.23 
 
 
352 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  30.25 
 
 
358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.7 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  34.66 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.33 
 
 
380 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  31.18 
 
 
352 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  30.56 
 
 
353 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 
367 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.92 
 
 
364 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  32.8 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  31.09 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  29.63 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  29.21 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  28.07 
 
 
387 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  29.35 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  29.36 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  28.8 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  28.8 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1636  Alkanesulfonate monooxygenase  31.66 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  28.01 
 
 
364 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 
378 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  29.64 
 
 
344 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  29.97 
 
 
367 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  26.1 
 
 
389 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  28.27 
 
 
406 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 
393 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  27.81 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  29.84 
 
 
387 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  27.65 
 
 
371 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 
380 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  33.1 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  28.89 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3622  Alkanesulfonate monooxygenase  24.58 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  30.49 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
395 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  29.81 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  32.65 
 
 
377 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  31.45 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  28.37 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  27.71 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  30.12 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  28.17 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  28.3 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  28.06 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  29.17 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  29.17 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3331  alkanesulfonate monooxygenase  29.6 
 
 
399 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  29.61 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  27.91 
 
 
396 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  31.72 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  28.72 
 
 
381 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  29.62 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 
387 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>