More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6062 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  100 
 
 		 369 aa  762    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  76.44 
 
 		 366 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  74.93 
 
 		 366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  71.63 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  71.9 
 
 		 363 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  74.08 
 
 		 369 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  73.09 
 
 		 364 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  70.88 
 
 		 364 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  73.58 
 
 		 366 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  71.27 
 
 		 364 aa  544  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  74.14 
 
 		 370 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  73.3 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  73.58 
 
 		 371 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  71.91 
 
 		 364 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  71.35 
 
 		 364 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  71.26 
 
 		 370 aa  534  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  71.55 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  68.7 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  68.7 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  68.7 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  69.41 
 
 		 367 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  69.69 
 
 		 367 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  67.4 
 
 		 378 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  69.12 
 
 		 367 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  68.56 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  68.41 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  68.41 
 
 		 364 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  68.13 
 
 		 364 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  68.13 
 
 		 364 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  60.61 
 
 		 369 aa  454  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  60 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  58.68 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  58.68 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  57.3 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  59.89 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  57.38 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  56.35 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  56.21 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54.57 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  49.73 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  31.65 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  31.14 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.46 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.83 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  30.68 
 
 		 367 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.54 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.18 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.38 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.38 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  29.43 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  29.49 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.81 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  29.54 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  27.95 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  27.53 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  31.48 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  31.02 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  28.33 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  31.07 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  29.23 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  28.18 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  28.37 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  29.63 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  29.75 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  29.81 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  27.88 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  27.22 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.4 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  30.42 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3362  alkanesulfonate monooxygenase  27.38 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  29.01 
 
 		 353 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  30.22 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  28.57 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  29.36 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  34.11 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  27.51 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  26.74 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  28.99 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1941  alkanesulfonate monooxygenase  27.95 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  28.99 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.11 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  29.52 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  27.63 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  31.18 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  29.61 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  31.17 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  29.15 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  28.86 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  26.72 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>