More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0547 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  84.49 
 
 
364 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  85.28 
 
 
363 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  85.67 
 
 
366 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  85.28 
 
 
363 aa  634    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  85.4 
 
 
366 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  88.64 
 
 
364 aa  661    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  85.47 
 
 
364 aa  634    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  85.75 
 
 
364 aa  634    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  100 
 
 
369 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  83.33 
 
 
364 aa  627  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  82.29 
 
 
366 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  76.88 
 
 
367 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  77.16 
 
 
367 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  76.6 
 
 
367 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  76.52 
 
 
367 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  77.16 
 
 
367 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  77.16 
 
 
367 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  79.14 
 
 
370 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  76.27 
 
 
367 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  76.11 
 
 
378 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  78.92 
 
 
370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  78.63 
 
 
370 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  75.56 
 
 
366 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  77.36 
 
 
371 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  75.55 
 
 
425 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  75.27 
 
 
364 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  75.27 
 
 
364 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  75.55 
 
 
364 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  74.08 
 
 
369 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  66.38 
 
 
369 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  64.97 
 
 
370 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  63.71 
 
 
389 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  63.71 
 
 
376 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  62.43 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  63.28 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  59.73 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  57.69 
 
 
403 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  56.15 
 
 
381 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  55.21 
 
 
382 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  55.08 
 
 
393 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  36.81 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  35.26 
 
 
352 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.67 
 
 
380 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.75 
 
 
362 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 
353 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.77 
 
 
387 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 
389 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  31.48 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  31.41 
 
 
389 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 
406 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 
350 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  30.81 
 
 
395 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  30.79 
 
 
392 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  30.55 
 
 
389 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  31.75 
 
 
371 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  29.73 
 
 
395 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  29.73 
 
 
395 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.45 
 
 
364 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  29.84 
 
 
386 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  29.94 
 
 
382 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  31.01 
 
 
354 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  29.35 
 
 
382 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  30.47 
 
 
381 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  29.68 
 
 
344 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  29.58 
 
 
381 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  34.51 
 
 
352 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  29.04 
 
 
370 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  29.86 
 
 
348 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  29.58 
 
 
351 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  28.96 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  29.04 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  31.65 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.99 
 
 
351 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  28.77 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  28.77 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  28.49 
 
 
370 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  29.01 
 
 
379 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  28.49 
 
 
370 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
389 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  28.77 
 
 
370 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  31.76 
 
 
377 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 
385 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31 
 
 
380 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  33.12 
 
 
360 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  29.16 
 
 
391 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  30.42 
 
 
380 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  32.1 
 
 
361 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 
380 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 
367 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  26.67 
 
 
355 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  28.31 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  31.49 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  29.58 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  29.41 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  27.79 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  30.34 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>