More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0148 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  82.72 
 
 
395 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
406 aa  822    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  83.51 
 
 
395 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  82.72 
 
 
395 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  83.51 
 
 
395 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  70.67 
 
 
353 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  58.4 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  58.79 
 
 
387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  54.71 
 
 
389 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  52.82 
 
 
389 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  51.15 
 
 
389 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  48.7 
 
 
392 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  33.42 
 
 
364 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.38 
 
 
380 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  35.71 
 
 
367 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
367 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
367 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  35.56 
 
 
367 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  35.56 
 
 
367 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  35.56 
 
 
367 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  35.56 
 
 
367 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  32.97 
 
 
364 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  30.25 
 
 
369 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  31.42 
 
 
363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  32.43 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  32.89 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  31.15 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  32.16 
 
 
364 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  30.43 
 
 
370 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  35.04 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  31.25 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 
370 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  29.51 
 
 
364 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  35.04 
 
 
364 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  32.36 
 
 
371 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  30.19 
 
 
366 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
384 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  34.69 
 
 
364 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  32.33 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  32.01 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 
364 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  30.48 
 
 
369 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 
366 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  31.87 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  34.53 
 
 
358 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  30.94 
 
 
369 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
370 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.41 
 
 
364 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  29.83 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  29.56 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  29.54 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  31.37 
 
 
376 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  30.05 
 
 
386 aa  146  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  29.48 
 
 
371 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  32.88 
 
 
366 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  29.95 
 
 
385 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  29.12 
 
 
382 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  32.51 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  31.5 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  32.26 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  33.79 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  29.01 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
363 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  33.24 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  33.24 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  33.24 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  33.24 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  33.24 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  33.24 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  31.3 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  33.61 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  32.25 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  28.46 
 
 
392 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  32.16 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  30.62 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  31.97 
 
 
360 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  29.35 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  31.88 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  31.9 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  31.68 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  28.27 
 
 
381 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 
370 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  28.68 
 
 
403 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  28.69 
 
 
393 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  31.4 
 
 
360 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  31 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  31.67 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  27.9 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  31.18 
 
 
381 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  29.41 
 
 
448 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  29.55 
 
 
448 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.6 
 
 
366 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  27.85 
 
 
440 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  31.36 
 
 
449 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  30.86 
 
 
350 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  30.56 
 
 
448 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  28.65 
 
 
454 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>