More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3950 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
370 aa  755    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  89.08 
 
 
371 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  92.42 
 
 
370 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  92.7 
 
 
370 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  80.44 
 
 
366 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  80.22 
 
 
366 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  80.45 
 
 
364 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  79.61 
 
 
364 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  80.34 
 
 
363 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  80.06 
 
 
363 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  78.63 
 
 
366 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  79.38 
 
 
364 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  78.02 
 
 
364 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  78.21 
 
 
366 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  78.51 
 
 
369 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  77.2 
 
 
364 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  72.93 
 
 
369 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  72.18 
 
 
367 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  72.18 
 
 
367 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  72.18 
 
 
367 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  73.52 
 
 
378 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  72.55 
 
 
367 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  71.79 
 
 
367 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  71.23 
 
 
367 aa  547  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  72.55 
 
 
367 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  73.88 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  73.88 
 
 
364 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  73.6 
 
 
364 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  74.15 
 
 
364 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  61.06 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  59.56 
 
 
389 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  59.56 
 
 
376 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  60.05 
 
 
385 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  59.83 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  60.23 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  57.57 
 
 
385 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  57.46 
 
 
381 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  54.64 
 
 
403 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  53.74 
 
 
393 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  51.7 
 
 
382 aa  350  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  35.31 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  34.66 
 
 
352 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  31.34 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.98 
 
 
380 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.92 
 
 
364 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
406 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 
367 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.87 
 
 
387 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  35.8 
 
 
350 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 
392 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  32.26 
 
 
389 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  31.04 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  30.77 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  30.77 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  32.22 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  30.68 
 
 
367 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.73 
 
 
351 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
389 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  34.2 
 
 
363 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  34.2 
 
 
363 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
353 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 
380 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.74 
 
 
381 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  30.06 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  34.29 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  32.09 
 
 
371 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  32.43 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
395 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  33.63 
 
 
365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  32.94 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 
368 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  28.57 
 
 
358 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  32.95 
 
 
348 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  33.05 
 
 
352 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  29.61 
 
 
386 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 
377 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  29.28 
 
 
389 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  32.46 
 
 
346 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
353 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 
344 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  34.26 
 
 
360 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  32.97 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  27.75 
 
 
389 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  32.95 
 
 
364 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  30.2 
 
 
382 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  32.4 
 
 
353 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  30.63 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  29.64 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
389 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
389 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
389 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  30.77 
 
 
385 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  31.43 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  29.83 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  31.18 
 
 
369 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>