More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1371 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  83.65 
 
 
389 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
369 aa  755    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  85.91 
 
 
370 aa  658    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  83.65 
 
 
376 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  80.85 
 
 
385 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  82.92 
 
 
383 aa  624  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  64.69 
 
 
403 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  68.18 
 
 
385 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  66.38 
 
 
369 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  64.8 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  64.27 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  64.09 
 
 
367 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  64.8 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  63.66 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  64.93 
 
 
364 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  64.62 
 
 
364 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  64.8 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  64.41 
 
 
366 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  65.38 
 
 
425 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  65.38 
 
 
364 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  64.38 
 
 
364 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  63.64 
 
 
363 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  63.36 
 
 
363 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  62.98 
 
 
367 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  64.23 
 
 
364 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  65.11 
 
 
364 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  65.37 
 
 
364 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  64.17 
 
 
366 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  63.84 
 
 
366 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  61.52 
 
 
366 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  61.31 
 
 
378 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  61.73 
 
 
364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  60.61 
 
 
369 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  61.14 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  59.94 
 
 
370 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  59.66 
 
 
370 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  59.54 
 
 
371 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  59.78 
 
 
381 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  51.93 
 
 
382 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54.12 
 
 
393 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.78 
 
 
380 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  33.33 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  32.78 
 
 
352 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  32.09 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  30.03 
 
 
362 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  34.77 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  32.11 
 
 
350 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.2 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  30.95 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  29.41 
 
 
351 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  29.69 
 
 
348 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 
389 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.53 
 
 
395 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  31.92 
 
 
389 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
346 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
389 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  28.01 
 
 
366 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  31.02 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  27.98 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.06 
 
 
381 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.82 
 
 
395 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.82 
 
 
395 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
395 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.85 
 
 
381 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 
367 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 
406 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  31.03 
 
 
371 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  30.89 
 
 
353 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  31.74 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  29.43 
 
 
389 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.29 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  30.39 
 
 
354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  32.85 
 
 
378 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  28.21 
 
 
358 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  31.99 
 
 
379 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  30.22 
 
 
375 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 
360 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.62 
 
 
381 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
392 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  29.18 
 
 
378 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  31.16 
 
 
364 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  30.58 
 
 
353 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.33 
 
 
381 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  29.68 
 
 
388 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  32.73 
 
 
364 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  29.7 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  29.75 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  29.7 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  30.72 
 
 
393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  29.89 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 
370 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  28.29 
 
 
355 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  29.53 
 
 
417 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  30.66 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2679  luciferase-like protein  28.53 
 
 
392 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.147238  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  31.43 
 
 
385 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  30.54 
 
 
362 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>