More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5009 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
366 aa  747    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  78.69 
 
 
366 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  77.62 
 
 
363 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  77.9 
 
 
363 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  77.99 
 
 
366 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  77.81 
 
 
364 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  79.77 
 
 
370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  76.82 
 
 
366 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  75.41 
 
 
364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  78.19 
 
 
364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  77.71 
 
 
370 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  78.74 
 
 
371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  75.41 
 
 
364 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  77.43 
 
 
370 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  75.56 
 
 
369 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  73.08 
 
 
367 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  73.08 
 
 
367 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  73.08 
 
 
367 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  73.68 
 
 
364 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  74.93 
 
 
369 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  72.7 
 
 
367 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  72.55 
 
 
367 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  72.19 
 
 
367 aa  554  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  72.55 
 
 
367 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  71.82 
 
 
378 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  69.34 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  69.61 
 
 
364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  69.34 
 
 
364 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  69.34 
 
 
364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  61.52 
 
 
369 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  59.46 
 
 
370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  59.94 
 
 
389 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  59.94 
 
 
376 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  60.56 
 
 
383 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  58.49 
 
 
385 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  58.06 
 
 
385 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  56.04 
 
 
403 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  55.4 
 
 
381 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54.02 
 
 
393 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 
382 aa  362  8e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.16 
 
 
380 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  33.33 
 
 
352 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  33.33 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  31.94 
 
 
362 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 
350 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  30.36 
 
 
386 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.06 
 
 
387 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 
392 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.44 
 
 
364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.5 
 
 
351 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  31.22 
 
 
354 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  30.45 
 
 
381 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.3 
 
 
406 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  32.12 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  29.97 
 
 
395 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  30.97 
 
 
389 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  29.22 
 
 
395 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  32.21 
 
 
351 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  29.22 
 
 
395 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  30.77 
 
 
385 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  27.64 
 
 
389 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  28.49 
 
 
366 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 
377 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  31.69 
 
 
363 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  31.69 
 
 
363 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 
353 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  29.35 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  32.17 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
395 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  31.07 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  26.52 
 
 
355 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  29.46 
 
 
387 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  32.01 
 
 
348 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  31.21 
 
 
371 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
389 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  31.84 
 
 
352 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
389 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  30.17 
 
 
344 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  31.18 
 
 
365 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  28.26 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 
353 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  27.99 
 
 
385 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  29.46 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  28.12 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  28.41 
 
 
382 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  30.25 
 
 
389 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  29.44 
 
 
391 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  30.9 
 
 
382 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  30.77 
 
 
386 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  28.53 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  30.84 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  30.63 
 
 
364 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 
382 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  29.45 
 
 
382 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  30.38 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  28.37 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>