More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1784 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  100 
 
 
393 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  57.46 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  56.9 
 
 
364 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  56.08 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  59.66 
 
 
364 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  56.09 
 
 
363 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  55.68 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  59.27 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  56.66 
 
 
363 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  55.37 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  59.27 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  58.99 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  54.32 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  54.57 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  54.93 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  54.32 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  54.32 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  56.53 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  54.42 
 
 
367 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  57.18 
 
 
389 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  55.34 
 
 
367 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  57.18 
 
 
376 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  56.27 
 
 
383 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  55.08 
 
 
369 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  53.87 
 
 
366 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  55.43 
 
 
369 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  54.02 
 
 
366 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  54.7 
 
 
366 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  54.78 
 
 
367 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  55.68 
 
 
364 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  54.57 
 
 
369 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  54 
 
 
364 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  55.68 
 
 
385 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  54.18 
 
 
370 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  54.6 
 
 
371 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  55.03 
 
 
382 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  54.76 
 
 
370 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  54.47 
 
 
370 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  53.02 
 
 
385 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  51.55 
 
 
381 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  38.06 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  37.46 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 
367 aa  155  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  30.33 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  34.24 
 
 
367 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.47 
 
 
380 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  32.37 
 
 
389 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.62 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.22 
 
 
381 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  32.41 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  33.65 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.77 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  29.13 
 
 
366 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  33.12 
 
 
385 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  31.23 
 
 
350 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  27.65 
 
 
386 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  32.5 
 
 
385 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  30.52 
 
 
387 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  33.09 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  33.12 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  34.06 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  30.43 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  31.74 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.33 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  31.83 
 
 
353 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  33.63 
 
 
364 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
353 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  31.29 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.44 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  27.2 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.67 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  30.58 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  32.41 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  27.3 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  33.79 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  33.12 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  32.65 
 
 
362 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  31.44 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  30.27 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  29.28 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.11 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  28.8 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  30.93 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  32.09 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  28.46 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.67 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  34.01 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  32.12 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>