More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2879 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  84.7 
 
 		 366 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  84.97 
 
 		 366 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  100 
 
 		 364 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  83.33 
 
 		 369 aa  627  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  80.72 
 
 		 364 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  82.73 
 
 		 364 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  83.38 
 
 		 364 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  83.19 
 
 		 363 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  82.91 
 
 		 363 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  82.95 
 
 		 364 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  79.89 
 
 		 367 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  80.97 
 
 		 366 aa  597  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  80.17 
 
 		 367 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  79.61 
 
 		 367 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  80.17 
 
 		 367 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  79.89 
 
 		 367 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  80.17 
 
 		 367 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  78.75 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  79.31 
 
 		 370 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  77.93 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  78.19 
 
 		 366 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  78.74 
 
 		 370 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  78.45 
 
 		 370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  78.1 
 
 		 371 aa  564  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  71.27 
 
 		 369 aa  544  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  75.5 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  74.93 
 
 		 364 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  75.5 
 
 		 364 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  75.21 
 
 		 364 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  61.73 
 
 		 369 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  61.5 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  61.5 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  60.39 
 
 		 370 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  59.73 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  62.5 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  60.16 
 
 		 385 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  56.08 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  56.82 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  53.07 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  35.14 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  34.32 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  33.42 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.16 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.92 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  33.06 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 392 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.64 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.05 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.86 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  31.78 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  31.78 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  33.91 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  32.17 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.45 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  32.73 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  30.77 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  33.54 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  34.59 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  33.92 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  27.76 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  29.13 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  31.93 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  32.92 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  29.69 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  30.55 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  30.4 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2678  Alkanesulfonate monooxygenase  30.54 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157068  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  29.82 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  30.23 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  30.23 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  31.16 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  30.47 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  31.45 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  30.33 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  31.23 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  31.23 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  31.3 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  30.56 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  30.93 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  31.2 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  30.93 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  30.86 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  26.49 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  29.76 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  30.9 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  30.9 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  30.2 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  26.81 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  32.6 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>