More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6035 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  96.72 
 
 		 367 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  97.81 
 
 		 367 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  93.99 
 
 		 367 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  99.18 
 
 		 367 aa  747    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  97.81 
 
 		 367 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  100 
 
 		 367 aa  752    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  97.81 
 
 		 367 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  91.48 
 
 		 378 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  79.83 
 
 		 364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  79.27 
 
 		 366 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  78.99 
 
 		 366 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  79.89 
 
 		 364 aa  597  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  80.8 
 
 		 364 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  75.7 
 
 		 364 aa  591  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  79.94 
 
 		 364 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  76.52 
 
 		 369 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  77.97 
 
 		 363 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  77.97 
 
 		 363 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  78.39 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  78.39 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  78.39 
 
 		 364 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  78.39 
 
 		 364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  76.92 
 
 		 366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  72.55 
 
 		 366 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  72.78 
 
 		 370 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  73.85 
 
 		 371 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  71.79 
 
 		 370 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  71.51 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  69.69 
 
 		 369 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  63.66 
 
 		 369 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  64.07 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  64.07 
 
 		 376 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  64.25 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  62.77 
 
 		 385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  59.89 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  57.78 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  55.96 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  55.87 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  54.78 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  36.71 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  35.62 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.24 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  30.94 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  33.6 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  33.33 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  33.33 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  34.38 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  34.09 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  31.74 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.95 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  31.56 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  29.8 
 
 		 389 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  31.28 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  31.28 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  30.64 
 
 		 381 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.68 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  31.28 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.57 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.48 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  29.78 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.29 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  29.13 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  31.9 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  31.01 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  31.01 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  30.03 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  27.02 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  30.81 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  30.05 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  31.12 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  30.45 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31.61 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  31.15 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  32.1 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  29.61 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2665  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  32.32 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  27.65 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  28.93 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  31.73 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  32.21 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  30.45 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.32 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  31.73 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  30.08 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.32 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3463  alkanesulfonate monooxygenase  32.29 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  31.6 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>