More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3362 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2757  alkanesulfonate monooxygenase  82.29 
 
 		 384 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0174174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1941  alkanesulfonate monooxygenase  83.07 
 
 		 384 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3362  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 384 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0437  Alkanesulfonate monooxygenase  53.89 
 
 		 382 aa  425  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3622  Alkanesulfonate monooxygenase  53.1 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4169  Alkanesulfonate monooxygenase  52.23 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.348397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2443  alkanesulfonate monooxygenase  51.82 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1660  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.350253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  35.52 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  35.52 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  35.52 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 		 387 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  34.36 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.7 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.43 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  34.28 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  34.52 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  32.02 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.17 
 
 		 387 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  33.42 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  32.98 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  33.98 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.03 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  34.71 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  30.85 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  31.73 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  32.87 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  30.81 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  30.81 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.07 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  32.51 
 
 		 388 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  32.04 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  30.59 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  33.16 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  30.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  30.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  31.77 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  34.62 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  33.71 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  32.5 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31.32 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  30.57 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  31.93 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  31.91 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  32.88 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  32.17 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  32.04 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  31.46 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  32.88 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  31.16 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  32.6 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  31.62 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  36.09 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  32.87 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  31.2 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  32.21 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  31.3 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  31.3 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  31.3 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1636  Alkanesulfonate monooxygenase  30.14 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  32.69 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  30.96 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  32.72 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  31.97 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  31.82 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  31.05 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  32.81 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  30 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  30.79 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  31.93 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  31.53 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  30.03 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  31.84 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  31.85 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  31.65 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  31.65 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  31.65 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  31.65 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  31.76 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  31.76 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  31.81 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  31.81 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>