More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0437 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0437  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
382 aa  783    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3622  Alkanesulfonate monooxygenase  60.58 
 
 
390 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4169  Alkanesulfonate monooxygenase  57.34 
 
 
377 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.348397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1941  alkanesulfonate monooxygenase  56.3 
 
 
384 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2757  alkanesulfonate monooxygenase  56.03 
 
 
384 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0174174 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3362  alkanesulfonate monooxygenase  53.89 
 
 
384 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1660  alkanesulfonate monooxygenase  52.29 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.350253  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2443  alkanesulfonate monooxygenase  52.29 
 
 
362 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  35.51 
 
 
381 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.13 
 
 
381 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.13 
 
 
381 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.53 
 
 
387 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  34 
 
 
379 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  35.53 
 
 
387 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  35.51 
 
 
395 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 
392 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  35.04 
 
 
382 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  36.54 
 
 
387 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  34.37 
 
 
371 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  32.76 
 
 
382 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  32.76 
 
 
382 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  34 
 
 
379 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 
377 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  35.93 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.73 
 
 
391 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  34.19 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  33.9 
 
 
380 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  33.9 
 
 
382 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  33.62 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  33.62 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  33.62 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  35.23 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.76 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  33.33 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  32.96 
 
 
382 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  32.96 
 
 
382 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.45 
 
 
391 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  35.24 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  34.39 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  33.98 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.15 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 
387 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
385 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  32.86 
 
 
380 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  34.19 
 
 
404 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  32.87 
 
 
382 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 
402 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  34.38 
 
 
405 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  32.7 
 
 
386 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  34.07 
 
 
386 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.18 
 
 
384 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  32.11 
 
 
382 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  33.6 
 
 
385 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  35.31 
 
 
384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  33.06 
 
 
385 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  34.08 
 
 
370 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  34.56 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 
370 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 
370 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
391 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  33.88 
 
 
391 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  31.71 
 
 
381 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
370 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  33.71 
 
 
395 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
370 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  32.32 
 
 
382 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  32.32 
 
 
382 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  33.6 
 
 
399 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  33.6 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  34.47 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1636  Alkanesulfonate monooxygenase  32.68 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.29 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  32.11 
 
 
382 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  32.22 
 
 
391 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  32.78 
 
 
387 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  31.39 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  32.45 
 
 
387 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  32.47 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  32.19 
 
 
387 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
385 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  32.88 
 
 
385 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
385 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  33.69 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
385 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  31.3 
 
 
387 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5472  sulfonate monooxygenase  31.55 
 
 
396 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  30.97 
 
 
382 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>