More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4328 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  76 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  44.33 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  44.85 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  46.79 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  46.79 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  43.93 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  46.12 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  42.37 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  38.57 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  37.43 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  38.98 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  38.98 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  38.98 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  32.68 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  38.42 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  37.29 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  39.77 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  48.55 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  29.6 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  36.13 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  39.77 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.12 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  36.76 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.91 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  35.57 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.6 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.94 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  35.03 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  35.91 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  35.91 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  35.05 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  35.91 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  34.65 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  31.93 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  37.36 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.58 
 
 		 306 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  42.22 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  32.99 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.97 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  40.27 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.67 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  36.93 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.14 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  30.18 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.9 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  36.65 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.22 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.05 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.35 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  38.98 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.92 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.92 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  35.18 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  34.95 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  34.57 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.17 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  34.59 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.22 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.86 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  30.68 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  30.68 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  30.68 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  32.43 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  29.43 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.21 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.68 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  35.41 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  27.72 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  29.5 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  27.72 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  33 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.48 
 
 		 352 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.02 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  31 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  33.16 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  32.46 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  27.34 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  37.21 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  32.35 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  32.64 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  33.66 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  36 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.41 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  25.17 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  36.99 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  34.44 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.52 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  30.45 
 
 		 364 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>