More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  79.67 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  70.43 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  73.48 
 
 		 321 aa  437  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  67.31 
 
 		 309 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  66.23 
 
 		 309 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  65.91 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  68.73 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  66.23 
 
 		 309 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  66.99 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  65.91 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  66.34 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  63.67 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.67 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  63.23 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  61.49 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  63.11 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  63.93 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  63.11 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  59.28 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  65.57 
 
 		 305 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  59.35 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  56.63 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  58.33 
 
 		 316 aa  345  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  59.42 
 
 		 316 aa  343  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  56.77 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  60.73 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  61.46 
 
 		 311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  38.64 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.2 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  34.63 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  39.55 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  36.19 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  36.19 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  35.8 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  38.21 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  38.21 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  34.63 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.77 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  38.21 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  32.37 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  32.37 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  35.87 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  33.97 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.05 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  36.09 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  34.51 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.08 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  34.35 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  34.35 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  34.35 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  32.72 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  33.6 
 
 		 338 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  33.6 
 
 		 338 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  33.6 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  32.85 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.28 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.3 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  35.17 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.6 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.38 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  32.66 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  32.61 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.54 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.02 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.47 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  31 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  37 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  34.63 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.64 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  35.38 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  31.74 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  33.46 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  34.08 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  33.22 
 
 		 484 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.31 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>