More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
311 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  72.03 
 
 
313 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  69.68 
 
 
308 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  71.38 
 
 
311 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  67.41 
 
 
311 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  65.92 
 
 
309 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  63.87 
 
 
316 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  61.09 
 
 
319 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  64.95 
 
 
308 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.67 
 
 
306 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  60.77 
 
 
309 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  60.45 
 
 
312 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  60.45 
 
 
309 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  64.84 
 
 
307 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  61.54 
 
 
313 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  59.24 
 
 
316 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  65.16 
 
 
305 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  64.19 
 
 
310 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  63.55 
 
 
307 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  61.04 
 
 
306 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  58.28 
 
 
316 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  60.88 
 
 
321 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  60.13 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  58.71 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  55.13 
 
 
316 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  55.77 
 
 
310 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  55.06 
 
 
317 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  57.78 
 
 
309 aa  331  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 
307 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  38.54 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.25 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.25 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  36.86 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.08 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  42.31 
 
 
282 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  37.5 
 
 
287 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 
281 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 
290 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  31.15 
 
 
322 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  39.57 
 
 
290 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.54 
 
 
321 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  33.44 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  33.23 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  34.18 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
287 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  31.7 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.39 
 
 
313 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.39 
 
 
313 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  33.48 
 
 
316 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  37.85 
 
 
300 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  37.38 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  37.38 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 
332 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.05 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.09 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.71 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.75 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.75 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.46 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.75 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.92 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  28.52 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  31.87 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  37.85 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  32.3 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.05 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  38.8 
 
 
293 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  31.31 
 
 
330 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.66 
 
 
347 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
339 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  31.1 
 
 
338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  31.1 
 
 
338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  31.1 
 
 
338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  26.62 
 
 
314 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  33.21 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  31.69 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  35.8 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 
288 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  33.91 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.88 
 
 
330 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  33.05 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  36.14 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.25 
 
 
287 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  33.94 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
327 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.2 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  31.25 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
332 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  34.45 
 
 
353 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  34.96 
 
 
350 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>