More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  94.1 
 
 		 339 aa  630  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  69.91 
 
 		 346 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  71.09 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  46.23 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  44.24 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  43.64 
 
 		 327 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  43.57 
 
 		 314 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  44.2 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  41.9 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.09 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  45.74 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  40.99 
 
 		 334 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  42.24 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  42.55 
 
 		 317 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  42.24 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  41.93 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  41.93 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  42.24 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  42.99 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  38.54 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  40.56 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  40 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  40.87 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  42.96 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  37.92 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  39.46 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  35.92 
 
 		 304 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  35.78 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  38.49 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  41.24 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  42.11 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  41.98 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  42.96 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  42.96 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  42.96 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  41.25 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  41.87 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  42.01 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.67 
 
 		 306 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  39.43 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  39.43 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  39.43 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  40.19 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  39.35 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  38.59 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  37.77 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.01 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.33 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  35.78 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  37.16 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.82 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  39.16 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  37.97 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  40.46 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.8 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  35.71 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.5 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  29.8 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.7 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  30.05 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.26 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.47 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  29.23 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  33.82 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.95 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.35 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.86 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.5 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.57 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  32.95 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  32.85 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.84 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.83 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  36.67 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  32.53 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.57 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.75 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.17 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40.8 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  39.09 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  39.84 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.4 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.24 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  36.17 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  39.02 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  27.23 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>