More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1981 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  100 
 
 		 327 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  79.44 
 
 		 327 aa  534  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  78.5 
 
 		 327 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  73.27 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  68.87 
 
 		 322 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  54.81 
 
 		 314 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  56.08 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  47.4 
 
 		 319 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  46.1 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  42.63 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  42.63 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  42.63 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  42.31 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  42.31 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  41.61 
 
 		 316 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  42.31 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  40.91 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  41.09 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  41.46 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  46.54 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  42.12 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  43.13 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  42.91 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  41.35 
 
 		 328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  41.9 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  41.56 
 
 		 325 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  39.25 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  41.67 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  39.06 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  39.06 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  39.06 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  41.31 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  39.88 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  38.74 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  39.74 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  39.41 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  40.92 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  36.65 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  38.44 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  38.98 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  37.42 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  37.86 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  37.86 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  35.48 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  36.92 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  36.92 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  36.92 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18420  hypothetical protein  74.53 
 
 		 106 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  32.44 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.07 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.84 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.37 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.87 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.41 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.17 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  36.67 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.8 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  34.78 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.5 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  36.99 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.33 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  36.91 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  36.91 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  36.91 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  27.8 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  34.78 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  27.8 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.43 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.68 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  41.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.94 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.74 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  28.43 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  40.35 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.91 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  39.47 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.65 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.21 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  27.56 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.43 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  31.28 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.66 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  38.6 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.15 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.24 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.65 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  32.58 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  32.58 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.2 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.17 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>