More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2279 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
311 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  45.05 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  43.65 
 
 
319 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  45.66 
 
 
319 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  43.35 
 
 
325 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  45.87 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  45.87 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  45.87 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  44.04 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  45.18 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  44.69 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  42.86 
 
 
313 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  39.48 
 
 
334 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  40.32 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  40.79 
 
 
342 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  40.92 
 
 
327 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  36.45 
 
 
316 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  40.46 
 
 
327 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  41.12 
 
 
327 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  42.44 
 
 
319 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  38.14 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  39.93 
 
 
316 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  35.53 
 
 
320 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  35.53 
 
 
317 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  35.53 
 
 
317 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  35.53 
 
 
317 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  35.53 
 
 
317 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  35.2 
 
 
317 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  43.71 
 
 
313 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  38.59 
 
 
328 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  37.66 
 
 
307 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  39.56 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  40.29 
 
 
319 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  39.78 
 
 
312 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.54 
 
 
339 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  38.33 
 
 
306 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  38.46 
 
 
325 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  38.73 
 
 
339 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  38.66 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  38.66 
 
 
316 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  35.44 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  33.86 
 
 
340 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  37.92 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  37.92 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  37.92 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  35.03 
 
 
322 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  32.27 
 
 
302 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  35.26 
 
 
359 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.37 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.67 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.89 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.07 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  29.08 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40.5 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.97 
 
 
278 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.86 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.72 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.8 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  33.72 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.21 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  33.72 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  35.29 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.82 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  34.78 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.55 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.86 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30.17 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  30.08 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.29 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  32.61 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.47 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  37.39 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.72 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.72 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.11 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  28.57 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  28.57 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 
753 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.29 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  32.34 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.23 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.11 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  26.83 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.46 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>