More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1694 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  100 
 
 		 334 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  59.62 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  59.11 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  58.28 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  55.18 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  53.02 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  47.78 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  45.43 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  42.26 
 
 		 316 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  43.55 
 
 		 322 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  44.38 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  43.37 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  42.41 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  43.03 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  42.07 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.46 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  44.27 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40.99 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  42.72 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  39.63 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  43.36 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  38.93 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  39.2 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  39.2 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  38.89 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  40 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  38.89 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  38.89 
 
 		 317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  39.48 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  38.58 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  39.93 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  39.93 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  40.07 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  40.07 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  40.07 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  36.04 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.7 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  37.62 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  40.46 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  35.54 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  35.54 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  35.54 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  38.41 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  38.14 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  35.14 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  36.65 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  36.65 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  31.1 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.56 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.8 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.23 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.56 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  30 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.93 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  28.2 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  32.98 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.18 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.35 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.73 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  24.64 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.22 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.5 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.86 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  30.65 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  31.43 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  29.13 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  33.33 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  31.58 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.84 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  31.33 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  34.06 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  31.33 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  33.33 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.57 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.35 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.13 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  32.62 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.68 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.49 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.95 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.83 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  28.11 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  28.04 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.17 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  40.4 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  39.81 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>