More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2848 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
306 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  33.44 
 
 
297 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
287 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  32.04 
 
 
293 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.77 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.22 
 
 
296 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.93 
 
 
281 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
282 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 
287 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.89 
 
 
313 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  32.44 
 
 
313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  32.44 
 
 
313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 
295 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  32 
 
 
310 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  29.93 
 
 
303 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.22 
 
 
310 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.83 
 
 
265 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
310 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  30.49 
 
 
287 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  35.68 
 
 
310 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  33.9 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
343 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 
262 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  30.79 
 
 
293 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  30.34 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  29.05 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  28.95 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  28.95 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  28.95 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.38 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  29.77 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  31.67 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  28.63 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  28.63 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  28.63 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  29.23 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  40 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  31.18 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  26.88 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.08 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  28.38 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  36.1 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  26.41 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  39.56 
 
 
284 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  33.19 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.19 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10043  oxidoreductase  29.36 
 
 
264 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  33.16 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  26.3 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.04 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.37 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  31.9 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  28.83 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 
753 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.77 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2902  hypothetical protein  28.4 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0865199  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  34.2 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  34.2 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  36.94 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  29.44 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  30.88 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.6 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0395  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  29.88 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  31.6 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
754 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2629  hypothetical protein  28.34 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2673  hypothetical protein  28.34 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6045  hypothetical protein  28.95 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0597189  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.81 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  34.2 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2657  hypothetical protein  28.34 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.23 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  27.34 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  29.22 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  29.21 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  28.71 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.74 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  30.21 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  33.9 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  27.97 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>