More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1594 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  69.35 
 
 
313 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  68.83 
 
 
316 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.31 
 
 
306 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  67.96 
 
 
308 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  66.02 
 
 
309 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  65.7 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  65.92 
 
 
311 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  66.03 
 
 
311 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  65.7 
 
 
309 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  67.1 
 
 
308 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 
306 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  65.16 
 
 
313 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  70.45 
 
 
307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  68.83 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  68.14 
 
 
321 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  63.75 
 
 
319 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  67.64 
 
 
305 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  65.92 
 
 
311 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  63.67 
 
 
311 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  59.11 
 
 
316 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  62.46 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  58.41 
 
 
316 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  59.74 
 
 
308 aa  358  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  60.97 
 
 
309 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  54.98 
 
 
310 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  54.98 
 
 
316 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  58.92 
 
 
317 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  40.38 
 
 
307 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  38.55 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  38.55 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  38.15 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  41.45 
 
 
281 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  34.87 
 
 
310 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  34.3 
 
 
310 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  37.5 
 
 
305 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  37.55 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  37.35 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
343 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
322 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 
287 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  35.62 
 
 
321 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  40.87 
 
 
282 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  33.01 
 
 
313 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  33.01 
 
 
313 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  36.19 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  36.19 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.66 
 
 
292 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.69 
 
 
313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 
320 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  38.89 
 
 
300 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  38.41 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 
316 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  32.01 
 
 
347 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  34.87 
 
 
294 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  36.05 
 
 
290 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.01 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  36.73 
 
 
298 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.03 
 
 
335 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 
288 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 
326 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.47 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  33.12 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  30.85 
 
 
338 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  30.85 
 
 
338 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  30.85 
 
 
338 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  28.81 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  36.84 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  31.25 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.07 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.07 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  32.17 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  32.17 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  32.17 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
327 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.93 
 
 
287 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 
330 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
288 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 
293 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  33.55 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  31.76 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  27.12 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  30.42 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  32.95 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 
287 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.76 
 
 
265 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
328 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 
484 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  34.21 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  35.84 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  29.31 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>