More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3880 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  92.72 
 
 		 316 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  60.26 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  60.06 
 
 		 313 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  59.87 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.28 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  58.41 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  57.61 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  56.19 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  59.62 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  58.58 
 
 		 313 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  58.1 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  58.52 
 
 		 312 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  58.1 
 
 		 309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  58.97 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.42 
 
 		 306 aa  343  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  54.95 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  59.49 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  58.04 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  58.01 
 
 		 307 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  54.78 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  56.37 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  54.19 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  53.65 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  56.7 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  39.12 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.78 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  35.33 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  39.74 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  38.28 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.01 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  35.08 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  38.63 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.05 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  39.33 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  38.13 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  38.13 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  37.74 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  41.5 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  41.5 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  37.45 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  33.98 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  33.98 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  40.18 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  33.98 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  34.29 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  37.59 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  34.29 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  33.65 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  32.57 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  38.36 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  30.1 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  34.22 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  32.01 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  35.74 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  32.39 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  39.89 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.46 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  33.55 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  33.56 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  38.43 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  41.57 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  32.31 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  36.6 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  32.31 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  32.31 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.3 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.12 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  38.33 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  31.48 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  31.54 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  34.87 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.88 
 
 		 265 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  30.36 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>