More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6911 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  100 
 
 		 325 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  60.91 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  61.06 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  39.76 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  36.72 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.8 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  37.54 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  35.67 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  32.06 
 
 		 289 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  35.49 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.26 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  34.29 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  33.55 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  32.42 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  43.2 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.02 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  32.43 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.62 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  33.1 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  35.16 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  31.71 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  31.71 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  31.71 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  33.12 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  30.45 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.99 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  30.19 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  32.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.35 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  32.71 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  32.19 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  31.13 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  31.13 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  31.13 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.81 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  39.56 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.15 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  37.84 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 		 282 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  38.46 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.07 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.55 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  32.77 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.2 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  29.97 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  40.12 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  33.18 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  29.63 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.54 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  29.63 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.87 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  37.87 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  33.16 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.36 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  28.9 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  31.97 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  29.66 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.16 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.29 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.78 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  29.06 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  27.78 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  41.6 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  41.6 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.5 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  35.42 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  29.65 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.4 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  37.02 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  30.74 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  30.66 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  37.91 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  30.28 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  30.28 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>