More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0282 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  100 
 
 
305 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  59.54 
 
 
307 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  48.25 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  41.8 
 
 
320 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.54 
 
 
311 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  39.41 
 
 
308 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  39.37 
 
 
316 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  39.12 
 
 
316 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.64 
 
 
306 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  39.55 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  37.3 
 
 
316 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  36.72 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
308 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
309 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
311 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  36.89 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  36.69 
 
 
307 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  35.08 
 
 
319 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
311 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  36.6 
 
 
306 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  37.79 
 
 
305 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  36.33 
 
 
310 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  38.11 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  38.46 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  34.63 
 
 
309 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  35.08 
 
 
312 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  34.63 
 
 
309 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.66 
 
 
310 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
321 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  33.23 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.08 
 
 
311 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  40.28 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  40.28 
 
 
285 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  40.28 
 
 
285 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  41.26 
 
 
287 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  41.55 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.84 
 
 
330 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  31.96 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.1 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 
281 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  36.95 
 
 
282 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.45 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  33.92 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  33.68 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  30.18 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  30.18 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.93 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
327 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  32.17 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  32.17 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  34.25 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  29.82 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.32 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.46 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  38.74 
 
 
287 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  30.43 
 
 
309 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  30.43 
 
 
309 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  30.43 
 
 
309 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.65 
 
 
265 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
257 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.7 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.96 
 
 
316 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 
330 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.91 
 
 
321 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  31.3 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
328 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  32.17 
 
 
335 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  35.56 
 
 
298 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2629  hypothetical protein  32.64 
 
 
269 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2673  hypothetical protein  32.64 
 
 
269 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2657  hypothetical protein  32.64 
 
 
269 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2936  hypothetical protein  32.23 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767256  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.07 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  34.21 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.3 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  36.24 
 
 
251 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.41 
 
 
309 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  36.11 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.78 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  35.19 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  35.19 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  39.55 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 
328 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  35.62 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  35.62 
 
 
264 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
326 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.62 
 
 
262 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  28.16 
 
 
309 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>